34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2552 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  100 
 
 		 939 aa  1859    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  39.23 
 
 		 986 aa  294  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  42.27 
 
 		 1088 aa  287  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  32.29 
 
 		 833 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  30.6 
 
 		 957 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1030 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  36.18 
 
 		 1744 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1183 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  24.92 
 
 		 833 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  26.39 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  26.22 
 
 		 469 aa  72  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  25.94 
 
 		 469 aa  72  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1119 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1101 aa  69.3  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1203 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1008 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  30.8 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  32.98 
 
 		 677 aa  62  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1080 aa  61.6  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1168 aa  58.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  29.55 
 
 		 792 aa  57  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  26.4 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  28.22 
 
 		 651 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  27.87 
 
 		 676 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  27.91 
 
 		 676 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  22.92 
 
 		 692 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  26.54 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  26.75 
 
 		 650 aa  47.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  31.5 
 
 		 503 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  26.45 
 
 		 737 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  28 
 
 		 647 aa  45.8  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  28.16 
 
 		 760 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  25.9 
 
 		 644 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  26.94 
 
 		 649 aa  44.3  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>