More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2225 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  51.56 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  49.12 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  50.67 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  50.67 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  50 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  50.45 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  47.27 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  37.08 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  37.95 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  33.91 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  33.48 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.18 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  26.61 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  34.52 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  27.39 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  32.07 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  27.39 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  29.15 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  28.64 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  30.26 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  29.6 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  28.64 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  28.64 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  30.26 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  29.23 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  29.26 
 
 		 357 aa  85.9  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  28.72 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.79 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  28.21 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  28.65 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  29.69 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  31.08 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  27.44 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  28.02 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  27.4 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  31.14 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  29.55 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  28.98 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  28.64 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  26.56 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.9 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  23.08 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  25.13 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  24.14 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  27.01 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.95 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  28.87 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  28.95 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.66 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  26.77 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  29.2 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  33.78 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  29.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  29.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  32.1 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  28.72 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  30.38 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  30.41 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1072  GMP synthase  30.41 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  30.41 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  31.95 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  28.78 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  25.77 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  31.48 
 
 		 540 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  28.76 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  28.28 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  27.27 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  27.42 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  30.41 
 
 		 525 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  29.31 
 
 		 525 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  31.48 
 
 		 538 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  25.56 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  28.97 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  34.38 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  26.88 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4587  GMP synthase  28.26 
 
 		 525 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  29.22 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  31.91 
 
 		 527 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1463  GMP synthase  32.03 
 
 		 539 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160024  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  26.9 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  29.19 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>