192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2028 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2028  putative allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.167818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2057  allophanate hydrolase subunit 1  58.09 
 
 		 256 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  37.74 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  34.55 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  35 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  33.93 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  29.51 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  31.74 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  29.15 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  31.74 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  28.38 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  32 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  31.7 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  34.05 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  31.42 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  30.7 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  32.22 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  31.92 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  25.88 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  23.79 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  29.82 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  34.38 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  30.74 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  30.23 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  30.87 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  30.87 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  29.28 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  33.76 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  34.82 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  31.06 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  37.59 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  32.16 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  30.09 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  31.92 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  37.04 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  34.53 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  27.23 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  37.19 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  25.56 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  30.52 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  26.24 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  26.58 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  34.27 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  25.44 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  33.14 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  37.6 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  36.8 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  22.08 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  33.49 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  22.08 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  35.54 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  35.67 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  30.05 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  27.6 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  24.43 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  29.11 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  29.11 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  32.4 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  27.88 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  34.4 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  22.48 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  29.11 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  28.64 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  29.11 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  34.4 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  34.4 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  34.4 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  34.4 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  22.32 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  35.38 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  28.17 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  29.11 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  34.71 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  36.59 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  28.17 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  28.17 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  36.59 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  25.64 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  28.64 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  34.88 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  28 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  22.32 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  31.94 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>