197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2057 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2057  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2028  putative allophanate hydrolase subunit 1  58.09 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.167818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  36.53 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  34.03 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  34.56 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  34.33 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  34.33 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  38.74 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  42.34 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  24.56 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  31.6 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  28.05 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  32.17 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  28.03 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  35.38 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  29.65 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  28.15 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  34.64 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  32.92 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  26.82 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  27.85 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  31.93 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  33.7 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  30.09 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  36.3 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  30.77 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  25.64 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.99 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  27.62 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  30.32 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  32.72 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.99 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  39.84 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  25.96 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  33.54 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  33.54 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  33.54 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  30.22 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  33.54 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  29.39 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.54 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  26.79 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  40.8 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.54 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  37.67 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  37.67 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  37.67 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  36.77 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  37.9 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  32.07 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  37.67 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  37.67 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  37.67 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  37.67 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  29.87 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  39.53 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  26.47 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  27.19 
 
 		 227 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  26.79 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  37.6 
 
 		 218 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  26.96 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  35.47 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  40.65 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  38.21 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  38.21 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  38.21 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  33.71 
 
 		 218 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  38.21 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  33.71 
 
 		 218 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  38.21 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  29.19 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  34.29 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  28.57 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  37.19 
 
 		 220 aa  85.5  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  33.71 
 
 		 218 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  36.92 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  33.14 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  29.46 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  34.56 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  27.83 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  32.57 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  35.71 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  34.56 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  28.84 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  31.64 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  21.62 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  21.62 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  31.07 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  31.07 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  31.07 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  34.29 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  31.07 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  31.07 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  31.07 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  31.85 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>