More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0837 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  67 
 
 
210 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.2 
 
 
213 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  58.57 
 
 
206 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  44.55 
 
 
209 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  45.63 
 
 
230 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.12 
 
 
209 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  44.33 
 
 
208 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  35.2 
 
 
203 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  38.95 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.55 
 
 
205 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
207 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  35.18 
 
 
203 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  30.61 
 
 
198 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  32.14 
 
 
216 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.69 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.86 
 
 
200 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  35.15 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  36.55 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  32.8 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.28 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.8 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.15 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  32.65 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  36.18 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  33.67 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.8 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  34.45 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.69 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  30.65 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  33.16 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  31.63 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  31.47 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  31.22 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  32.99 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  31.91 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  33.66 
 
 
199 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.11 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.11 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.11 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  33.84 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  34.34 
 
 
234 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
214 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
209 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  32.21 
 
 
297 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  29.65 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  28.79 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.5 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
266 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
232 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  32.14 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  30.69 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  29.03 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  31.75 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  31.05 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.77 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  28.35 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  34.8 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
205 aa  89  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  32.65 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 
214 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  31.79 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.35 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 
232 aa  88.2  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  29.95 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.77 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  27.08 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  30.35 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  30.46 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  29.47 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  30.61 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  29.23 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  28.87 
 
 
235 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  31.31 
 
 
223 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  29.29 
 
 
219 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>