48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0611 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  52.94 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  51.96 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  53.4 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  52 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  45.1 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  56.86 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  47 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  47 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  46.08 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  47.06 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  45 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  42.16 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  44.66 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  50 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  47.06 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  47.06 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  41.18 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  41.75 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  36.36 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  35.35 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  34.31 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  33.68 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  35.79 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  38.89 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  31.25 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  31.25 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  32.63 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  31.58 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  29.91 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  30.69 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  29.81 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  28.71 
 
 		 388 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  28.85 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 317 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  26.92 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  26.92 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  26.92 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  29.81 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  25.96 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  29.36 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  28.85 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>