More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2535 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  100 
 
 		 114 aa  226  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  81.55 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 103 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 103 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  59.41 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  51.85 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  51.82 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  52 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.25 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.57 
 
 		 223 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 224 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 208 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  49 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  96.7  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>