More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2074 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  72.67 
 
 
316 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  72.49 
 
 
315 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.26 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.58 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  67.96 
 
 
320 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  61.59 
 
 
316 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  60.19 
 
 
317 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55.63 
 
 
326 aa  353  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.61 
 
 
313 aa  342  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  54.69 
 
 
321 aa  324  1e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55.66 
 
 
319 aa  322  4e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  53.44 
 
 
314 aa  318  5e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.27 
 
 
323 aa  317  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.12 
 
 
325 aa  315  6e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  53.95 
 
 
318 aa  312  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  51.52 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  50.32 
 
 
321 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  51.92 
 
 
314 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.92 
 
 
314 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.81 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.98 
 
 
317 aa  275  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.69 
 
 
331 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  43 
 
 
313 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  42.16 
 
 
311 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  43 
 
 
314 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.76 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.19 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.56 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  38.83 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.06 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.05 
 
 
313 aa  219  6e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.1 
 
 
311 aa  218  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.57 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.05 
 
 
330 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.93 
 
 
329 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  39.81 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.19 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.39 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.24 
 
 
338 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.77 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.05 
 
 
323 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.75 
 
 
328 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.12 
 
 
328 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.88 
 
 
324 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.88 
 
 
324 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.94 
 
 
325 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.33 
 
 
314 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.5 
 
 
325 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.38 
 
 
332 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.12 
 
 
334 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.38 
 
 
332 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.38 
 
 
332 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.17 
 
 
338 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.22 
 
 
342 aa  201  9e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.89 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.56 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.94 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.7 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.94 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.88 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.94 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.51 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.2 
 
 
342 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.76 
 
 
335 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.63 
 
 
330 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.05 
 
 
352 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.75 
 
 
331 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.34 
 
 
323 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.64 
 
 
312 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.39 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  35.13 
 
 
348 aa  189  4e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.78 
 
 
369 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.17 
 
 
345 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.41 
 
 
323 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.13 
 
 
325 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.26 
 
 
323 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.19 
 
 
334 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 
327 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.15 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.18 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.68 
 
 
353 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.94 
 
 
334 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.3 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.54 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  36.18 
 
 
355 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.09 
 
 
386 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.71 
 
 
353 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.93 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.94 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.82 
 
 
321 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  32.49 
 
 
363 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  32.21 
 
 
363 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.93 
 
 
378 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.38 
 
 
356 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.38 
 
 
356 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.38 
 
 
356 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  37.38 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  35.76 
 
 
316 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>