More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1910 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  100 
 
 
210 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  52.33 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  53.26 
 
 
203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  51.08 
 
 
203 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  54.6 
 
 
211 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  48.91 
 
 
202 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  51.85 
 
 
224 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  48.91 
 
 
202 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  51.06 
 
 
210 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  51.89 
 
 
207 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  51.35 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  51.89 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  51.89 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  51.89 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  51.89 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  51.35 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  49.44 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  49.45 
 
 
209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  50.79 
 
 
224 aa  181  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  48.13 
 
 
202 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0439  guanylate kinase  47.03 
 
 
205 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  45.99 
 
 
210 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  51.11 
 
 
207 aa  178  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  49.73 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  48.63 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  50.27 
 
 
207 aa  177  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  52.81 
 
 
207 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  50 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0669  guanylate kinase  49.73 
 
 
228 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.877591  normal  0.744923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  50.81 
 
 
206 aa  174  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  49.47 
 
 
209 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.25 
 
 
204 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  49.46 
 
 
202 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  45.88 
 
 
221 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  48.63 
 
 
227 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  49.18 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  49.18 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  49.73 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  49.18 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  45.7 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  48.92 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  48.33 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  49.18 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  50.85 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  49.46 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  49.18 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  45.36 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  48.65 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  49.18 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  48.11 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  49.14 
 
 
216 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  45.36 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  46.91 
 
 
215 aa  171  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  48.63 
 
 
227 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3085  guanylate kinase  50 
 
 
226 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.831514  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  48.17 
 
 
229 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  44.26 
 
 
207 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  46.15 
 
 
225 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  46.32 
 
 
220 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  50 
 
 
189 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  47.89 
 
 
202 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  46.15 
 
 
207 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  46.7 
 
 
206 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  46.84 
 
 
206 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  46.84 
 
 
206 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  45.88 
 
 
210 aa  168  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  47.46 
 
 
195 aa  167  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  47.59 
 
 
207 aa  167  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  46.7 
 
 
206 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  46.7 
 
 
206 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  46.74 
 
 
202 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  47.59 
 
 
207 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  47.34 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  46.52 
 
 
206 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  48.15 
 
 
213 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  48.65 
 
 
203 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  48.65 
 
 
203 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  49.72 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  41.05 
 
 
204 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  48.86 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  44.92 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  46.84 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  45.45 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  46.84 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  44.92 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  41.85 
 
 
204 aa  162  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  45.36 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  47.22 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  47.22 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  44.92 
 
 
204 aa  161  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>