More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0669 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0669  guanylate kinase  100 
 
 
228 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.877591  normal  0.744923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  91.74 
 
 
225 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3085  guanylate kinase  90.37 
 
 
226 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.831514  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  88.68 
 
 
227 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  86.79 
 
 
227 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  86.79 
 
 
227 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  85.85 
 
 
227 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  85.38 
 
 
227 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  78.54 
 
 
216 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  77.94 
 
 
216 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  75.24 
 
 
221 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  74.76 
 
 
221 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  72.86 
 
 
221 aa  315  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  59.69 
 
 
204 aa  241  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  55.17 
 
 
212 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  55.17 
 
 
212 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  55 
 
 
210 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  54.77 
 
 
202 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  52.76 
 
 
204 aa  221  8e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  52.76 
 
 
204 aa  218  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  51.26 
 
 
202 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  51.69 
 
 
221 aa  214  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  53.27 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  52.91 
 
 
203 aa  211  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  50.75 
 
 
229 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  51 
 
 
207 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  52 
 
 
207 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  49.75 
 
 
208 aa  203  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  52.28 
 
 
209 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  51.26 
 
 
215 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  50 
 
 
213 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  48.51 
 
 
210 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  49 
 
 
207 aa  201  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  52.22 
 
 
206 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  50.72 
 
 
212 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  50.72 
 
 
212 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  49.75 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  49.25 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  50.25 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  50 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  49.75 
 
 
206 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  50.25 
 
 
207 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  48.24 
 
 
204 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  48.74 
 
 
205 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  49.25 
 
 
207 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  51.23 
 
 
206 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  50.74 
 
 
206 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  47.83 
 
 
218 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  50.25 
 
 
210 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  49.5 
 
 
207 aa  198  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  51.26 
 
 
211 aa  197  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  50 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  48.74 
 
 
206 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  50.75 
 
 
203 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  50.75 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  49.5 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  47.74 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  49.5 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  49.5 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  49.25 
 
 
206 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  49.5 
 
 
207 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.76 
 
 
207 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  49 
 
 
207 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  49.75 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  49.75 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  48.24 
 
 
205 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  48.24 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  50.5 
 
 
224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  49.26 
 
 
206 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  49 
 
 
207 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  52.94 
 
 
206 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  47.83 
 
 
220 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  47.74 
 
 
205 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  48.26 
 
 
207 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  47.76 
 
 
207 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>