More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0665 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.33 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  44.54 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
220 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
225 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.53 
 
 
223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.62 
 
 
220 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  34.53 
 
 
223 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
235 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
268 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.98 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1416  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.48 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.39 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.63 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.34 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  25.55 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  28.14 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.14 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  27.19 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  26.94 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.14 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.14 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.14 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.78 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0173  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00691554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  25.91 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  25.65 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.11 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  27.5 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  28.19 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.37 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
258 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.49 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.27 
 
 
659 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.57 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  31.96 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.84 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.26 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  29.58 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.78 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.64 
 
 
717 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.46 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.53 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  26.47 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  32.53 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.53 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  32.53 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.19 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  31.93 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25.64 
 
 
727 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  28.95 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.19 
 
 
719 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.47 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.51 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  25.22 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  25.22 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  27.31 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.19 
 
 
719 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  32.91 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>