More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0623 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  100 
 
 		 323 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  32.72 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  30.75 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3147  two component signal sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  30.65 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 410 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  33.73 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  33.99 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 901 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 585 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 590 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 528 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.63 
 
 		 906 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 608 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  30.99 
 
 		 913 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  30.83 
 
 		 591 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 582 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  31.36 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 581 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 932 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  31.65 
 
 		 903 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.74 
 
 		 560 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  33.61 
 
 		 935 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 470 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  29.26 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  29.26 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  29.26 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  29.31 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 594 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  30.67 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1145 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 596 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 590 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  31.82 
 
 		 565 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.93 
 
 		 508 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  28.7 
 
 		 465 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  31.3 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 917 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 489 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 637 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 920 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  32.05 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 597 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 945 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 430 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 463 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  30.21 
 
 		 927 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 487 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  34.05 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1153 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  29.39 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 2161 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 461 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.57 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.57 
 
 		 587 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  32.19 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 587 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 504 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  29.03 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  29.61 
 
 		 557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  30.74 
 
 		 473 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.41 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 457 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30 
 
 		 587 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 590 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 599 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 815 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  31.91 
 
 		 919 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1141 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 589 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 608 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.57 
 
 		 587 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 585 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 592 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.57 
 
 		 587 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 597 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  32.79 
 
 		 554 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.57 
 
 		 587 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.57 
 
 		 587 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 554 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.57 
 
 		 587 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  31.28 
 
 		 423 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1352 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 458 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 919 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  30.33 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>