28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0305 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  34.76 
 
 		 538 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  33.33 
 
 		 555 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  31.08 
 
 		 545 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  30.63 
 
 		 556 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  31.55 
 
 		 557 aa  96.7  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  27.73 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  34.06 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0567  cytochrome c class III  42.22 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  27.4 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  29.23 
 
 		 126 aa  51.6  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  30.32 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  25.78 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  27.01 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2715  acidic cytochrome c3  29.52 
 
 		 126 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3710  acidic cytochrome c3  28.36 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  23.68 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  33.68 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  28.67 
 
 		 135 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  26.49 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2554  acidic cytochrome c3  30.89 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  24.29 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  28.67 
 
 		 136 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  30.77 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  22.34 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 337 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0847  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00928688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  40.82 
 
 		 92 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>