239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_534 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  98.11 
 
 		 159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  88.27 
 
 		 162 aa  286  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  46 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  50.98 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  45.45 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  45.39 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  46.62 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  53.23 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  48 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  45.95 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  47.62 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  49.19 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  44.67 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  49.6 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  45.86 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  46.09 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  46.31 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  45.95 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  44.81 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.8 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  51.2 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.2 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.95 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  45.6 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  42.42 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  42.42 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  40.34 
 
 		 207 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  42.42 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  45.75 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  44.35 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  44.44 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  37.78 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  40.83 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  38.66 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.84 
 
 		 283 aa  77.4  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  41.46 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  35.88 
 
 		 240 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  43.7 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  35.66 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  35.88 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  35.87 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  35 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  32.33 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  35.11 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  36.96 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  33.08 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  39.66 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  37.4 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  36.43 
 
 		 289 aa  67.8  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  34.31 
 
 		 216 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  33.08 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  29.31 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  33.83 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  38.26 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  31.58 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  35.77 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  31.62 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  29.14 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  38.79 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  33.85 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  28.06 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  31.39 
 
 		 239 aa  63.9  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  33.83 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  35.88 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  33.83 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.65 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  32.17 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  34.56 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  32.05 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2422  hypothetical protein  33.83 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  33.91 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  32.06 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  32.12 
 
 		 217 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  27.34 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  35.65 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  30.08 
 
 		 266 aa  60.5  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  30.66 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  33.04 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  32.84 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  42.86 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  33.91 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  30.25 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  31.53 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  29.32 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  32.12 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  35.16 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  30.3 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>