90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1271 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  86.08 
 
 		 273 aa  487  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  86.45 
 
 		 273 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  31.28 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  32.24 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.84 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  32.59 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.59 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  28.31 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.82 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.92 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  36.18 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  30.41 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  34.44 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  32.43 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.79 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  28.24 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  27.39 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  24.75 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  25.57 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  30.98 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  27.32 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  26.98 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  26.64 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  22.64 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.88 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  37.78 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  26.58 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  24.42 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  27.22 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  24.65 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  25.59 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  33 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.55 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.38 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.61 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  26.52 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  25.25 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  26.7 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  27.08 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.26 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  22.93 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  22.81 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  29.66 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  29.37 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  25 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 991 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03579  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  33.72 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0139639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  37.88 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.59 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  41.89 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.87 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  28.72 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.41 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.4 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.93 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  38.75 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  37.97 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.886527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 190 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  34.29 
 
 		 255 aa  42  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.93 
 
 		 280 aa  42  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 259 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>