More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_114 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  100 
 
 		 328 aa  653    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  87.5 
 
 		 328 aa  584  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  86.59 
 
 		 328 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  54.03 
 
 		 279 aa  271  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  48.57 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  48.98 
 
 		 276 aa  263  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  53.5 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  52.26 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  48.76 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  49.6 
 
 		 262 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.63 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  48.99 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  51.27 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  48.07 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  48.74 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  44.62 
 
 		 269 aa  229  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  45.53 
 
 		 284 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  48.98 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  45.11 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  45.82 
 
 		 280 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  48.34 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  46.51 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  39.17 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.03 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  37.1 
 
 		 358 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.03 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  36.51 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  49.58 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  43.48 
 
 		 272 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  37.25 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.09 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  36.42 
 
 		 358 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.68 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  36.25 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.5 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.03 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  38.73 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.5 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.13 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  35.74 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  43.62 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  37.83 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  35.38 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  37.79 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  36.79 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  35.62 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.64 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  41.05 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  42.06 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.83 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  34.47 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  35.37 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  34.47 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  36.88 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  35.49 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  42.6 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  35.49 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  33.76 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.64 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  36 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  34.72 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  41.23 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  43.05 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  36.89 
 
 		 368 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  44.74 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  43.95 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  35.85 
 
 		 373 aa  185  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  42.98 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  35.91 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  35.11 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  44.44 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  36.42 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.1 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  42.86 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  42.98 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.53 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.04 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  40.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  40.77 
 
 		 373 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  34.81 
 
 		 367 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  41.88 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  34.25 
 
 		 357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  34.04 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  42.15 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2138  hypothetical protein  41.03 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  34.26 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  35.29 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  34.52 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  36.64 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  44.25 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  34.25 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  41.7 
 
 		 278 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  40.09 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0041  hypothetical protein  40.68 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0118047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  43.05 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  40.36 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  44.25 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  41.67 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>