More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3595 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 607 aa  1244    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.74 
 
 		 626 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.57 
 
 		 624 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.09 
 
 		 605 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  41.18 
 
 		 595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  41.18 
 
 		 595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  37.58 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  38.33 
 
 		 596 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.47 
 
 		 598 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.14 
 
 		 610 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.66 
 
 		 610 aa  330  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.89 
 
 		 593 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.87 
 
 		 615 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.22 
 
 		 590 aa  307  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.78 
 
 		 597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.52 
 
 		 604 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.16 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.72 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 		 590 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  35.58 
 
 		 597 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.79 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  30.59 
 
 		 601 aa  260  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.56 
 
 		 618 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  39.27 
 
 		 243 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.6 
 
 		 555 aa  156  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.29 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.29 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  27.04 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.83 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  26.46 
 
 		 521 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  55.36 
 
 		 112 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  25.65 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.16 
 
 		 442 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.37 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.75 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.6 
 
 		 558 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.03 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  25.81 
 
 		 538 aa  117  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.37 
 
 		 423 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  32 
 
 		 956 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.22 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  26.03 
 
 		 895 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 893 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 860 aa  97.4  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  33.94 
 
 		 846 aa  97.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.68 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 903 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  33.67 
 
 		 865 aa  95.5  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 870 aa  94.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  33.48 
 
 		 846 aa  94.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  31.1 
 
 		 881 aa  94.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.08 
 
 		 864 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  31.05 
 
 		 931 aa  93.2  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  29.89 
 
 		 892 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 892 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 870 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 890 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 890 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 892 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  31.73 
 
 		 896 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 870 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 903 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 910 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 910 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 840 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  32.11 
 
 		 878 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 895 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  27.98 
 
 		 1085 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 894 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 892 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 892 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  33.47 
 
 		 897 aa  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 892 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 890 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 892 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 		 853 aa  90.9  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 868 aa  90.9  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  32.14 
 
 		 905 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  28.27 
 
 		 1088 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  32.66 
 
 		 927 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 856 aa  90.5  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 		 1014 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 		 854 aa  89  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 872 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 855 aa  89.4  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 860 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 		 855 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  32.37 
 
 		 750 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 853 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 881 aa  89  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  24.85 
 
 		 793 aa  88.6  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 		 918 aa  88.2  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 		 868 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  30.49 
 
 		 917 aa  88.2  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>