More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1758 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 391 aa  770    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  51.62 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  45.71 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  43.64 
 
 		 388 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  45.99 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  44.96 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  43.73 
 
 		 400 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  51.9 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  42.29 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.42 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  45.05 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  45 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  41.21 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  40.53 
 
 		 382 aa  298  8e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 		 385 aa  298  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.6 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  40.78 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.73 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  40.89 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  39.84 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  38.78 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.01 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  41.1 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  39.33 
 
 		 402 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  39.16 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.04 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  39.64 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.66 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  39.38 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  36.39 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.17 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  38.9 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.68 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  39.05 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.63 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.14 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  36.65 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.11 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  36.39 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  35.96 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  35.7 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  41.53 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  38.69 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  35.96 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  38.17 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  35.7 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.11 
 
 		 390 aa  262  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  41.47 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  34.91 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  35.17 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 		 391 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.42 
 
 		 392 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  35.86 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  35.08 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  34.82 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  36.34 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  34.55 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  35.7 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.2 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  37.43 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  36.07 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  35.37 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 		 414 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  35.81 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  37.4 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  37.2 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  35.36 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  36.51 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  36.51 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  34.46 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  34.76 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  35.08 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  35.54 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  36.07 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  35.54 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  35.54 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  35.28 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 403 aa  245  8e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  35.81 
 
 		 402 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  34.82 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  35.28 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  35.81 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  36.91 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  37.2 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>