More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3182 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  100 
 
 
384 aa  765    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  69.27 
 
 
388 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  46.44 
 
 
392 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  45.91 
 
 
392 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  45.41 
 
 
388 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  51.9 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  45.62 
 
 
390 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  43.51 
 
 
400 aa  329  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  46.44 
 
 
390 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  42.04 
 
 
407 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  45.33 
 
 
392 aa  315  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.62 
 
 
385 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  40.65 
 
 
389 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  41.4 
 
 
403 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  43.82 
 
 
387 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  41.35 
 
 
388 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  41.3 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.48 
 
 
385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.11 
 
 
392 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  38.71 
 
 
384 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  38.27 
 
 
399 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  39.68 
 
 
388 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  39.35 
 
 
399 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  38.98 
 
 
394 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  38.98 
 
 
394 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  38.52 
 
 
402 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  37.1 
 
 
382 aa  275  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.84 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
399 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
399 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 
382 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  37.11 
 
 
382 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
399 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  38.87 
 
 
392 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.04 
 
 
388 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
400 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
400 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  38.7 
 
 
411 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  38.7 
 
 
411 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
399 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  38.7 
 
 
411 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
399 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.89 
 
 
388 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 
382 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  38.44 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  38.7 
 
 
411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.08 
 
 
390 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  38.96 
 
 
407 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  38.03 
 
 
390 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.49 
 
 
389 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  39.67 
 
 
414 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  36.99 
 
 
413 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  38.18 
 
 
411 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  37.92 
 
 
402 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  37.92 
 
 
402 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2123  aminotransferase class I and II  39.22 
 
 
401 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00510874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  38.44 
 
 
411 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2213  aminotransferase class I and II  39.22 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  37.92 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  37.89 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  38.18 
 
 
409 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1724  aminotransferase  39.38 
 
 
401 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  37.66 
 
 
402 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  37.66 
 
 
412 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.44 
 
 
390 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  37.27 
 
 
389 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  36.83 
 
 
395 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  37.73 
 
 
412 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  37.73 
 
 
412 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
412 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  37.14 
 
 
402 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  37.73 
 
 
412 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  37.73 
 
 
412 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  37.73 
 
 
412 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  37.66 
 
 
413 aa  259  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  37.14 
 
 
412 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  37.14 
 
 
412 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  37.14 
 
 
412 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  37.14 
 
 
412 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  37.14 
 
 
402 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  37.14 
 
 
412 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  37.4 
 
 
412 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  37.14 
 
 
411 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  37.47 
 
 
412 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  37.66 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  36.22 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  37.8 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  37.4 
 
 
405 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.2 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.3 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  36.86 
 
 
402 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.58 
 
 
388 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  35.03 
 
 
401 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  34.39 
 
 
391 aa  250  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  36.98 
 
 
405 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>