More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1108 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 246 aa  480  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  27 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.39 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.95 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.01 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.41 
 
 		 367 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 284 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.06 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.38 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 308 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  26.23 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.99 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35 
 
 		 370 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 		 279 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 279 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 		 279 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 		 279 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.98 
 
 		 370 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.2 
 
 		 370 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  29.13 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.41 
 
 		 370 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 308 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 301 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.08 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.59 
 
 		 371 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  25.37 
 
 		 279 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 571 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.37 
 
 		 279 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 277 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 298 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 309 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.89 
 
 		 370 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 		 292 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.37 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 310 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 283 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  25.37 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.83 
 
 		 283 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 421 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  30.74 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.67 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 288 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 288 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 		 312 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 295 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 312 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>