38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3101 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  46 
 
 		 901 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  100 
 
 		 830 aa  1684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  41.23 
 
 		 825 aa  592  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  39.18 
 
 		 809 aa  556  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  38.49 
 
 		 801 aa  555  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  37.55 
 
 		 812 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  38.76 
 
 		 839 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  37.56 
 
 		 795 aa  506  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  36.45 
 
 		 847 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  35.14 
 
 		 840 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  30.63 
 
 		 836 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  23.61 
 
 		 786 aa  144  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  24.22 
 
 		 818 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  24.06 
 
 		 819 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  23.42 
 
 		 805 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  23.73 
 
 		 788 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  24.26 
 
 		 886 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  22.65 
 
 		 819 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  20.98 
 
 		 821 aa  108  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  27.16 
 
 		 798 aa  101  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  20.43 
 
 		 800 aa  98.2  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  23.91 
 
 		 784 aa  97.8  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  20.55 
 
 		 810 aa  90.9  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  23.5 
 
 		 726 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  28.81 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  22.11 
 
 		 822 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  24.6 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  24.53 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  23.14 
 
 		 801 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  23.5 
 
 		 809 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  28.04 
 
 		 801 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  27.59 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1828  hypothetical protein  25 
 
 		 796 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  25 
 
 		 821 aa  53.5  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  22.4 
 
 		 728 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3982  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1024 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0823413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1047 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  28.32 
 
 		 870 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>