More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2460 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 		 409 aa  839    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.25 
 
 		 204 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 		 207 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.18 
 
 		 212 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  42.16 
 
 		 212 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.15 
 
 		 203 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 		 647 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0119  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.47 
 
 		 210 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2467  thiamine monophosphate synthase  41.58 
 
 		 203 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0622  thiamine monophosphate synthase  35.75 
 
 		 204 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.27 
 
 		 365 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1602  thiamine monophosphate synthase  39.59 
 
 		 203 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.31 
 
 		 209 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  34.33 
 
 		 206 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.22 
 
 		 207 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.84 
 
 		 351 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 		 211 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.22 
 
 		 220 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.54 
 
 		 205 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.07 
 
 		 214 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  34.52 
 
 		 204 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 		 205 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.53 
 
 		 206 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.72 
 
 		 206 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.73 
 
 		 207 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.34 
 
 		 220 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.9 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.72 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.03 
 
 		 207 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 		 206 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  37.95 
 
 		 208 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.36 
 
 		 220 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.68 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.93 
 
 		 219 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.92 
 
 		 207 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.01 
 
 		 206 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.51 
 
 		 346 aa  100  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 		 218 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4280  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 		 208 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147204  hitchhiker  0.00418182 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  34.95 
 
 		 217 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 		 208 aa  99.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.86 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.57 
 
 		 221 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 208 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.88 
 
 		 217 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  31.03 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 		 210 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.46 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.17 
 
 		 208 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.43 
 
 		 207 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03870  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 		 211 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4535  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 		 211 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4032  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 		 211 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  36.27 
 
 		 212 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.94 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.78 
 
 		 205 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03823  hypothetical protein  34.04 
 
 		 211 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 		 204 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.24 
 
 		 218 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.62 
 
 		 211 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.84 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 219 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.21 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4484  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.07 
 
 		 211 aa  94.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0206  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.42 
 
 		 211 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0014  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.13 
 
 		 225 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.71 
 
 		 218 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.64 
 
 		 202 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.51 
 
 		 214 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 		 211 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.262167 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4001  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 		 211 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 221 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 		 211 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.87 
 
 		 212 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.26 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.61 
 
 		 218 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 		 220 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.98196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.51 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.67 
 
 		 208 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.37 
 
 		 221 aa  92  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3889  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.74 
 
 		 208 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  31.22 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.28 
 
 		 219 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 		 210 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 		 219 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.25 
 
 		 217 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4373  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 		 211 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.28 
 
 		 219 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>