More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2171 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
324 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  66.04 
 
 
345 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  64.71 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.22 
 
 
327 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  44.74 
 
 
280 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.84 
 
 
312 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
290 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
291 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
302 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.2 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.49 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
320 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
333 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.88 
 
 
295 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
347 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
316 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
347 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
300 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
324 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
351 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
310 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
347 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
233 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
321 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
235 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
314 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
338 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.57 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
289 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.15 
 
 
341 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
230 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
450 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
1250 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.38 
 
 
367 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
597 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  40.32 
 
 
663 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
318 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
249 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
274 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  28.21 
 
 
255 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
573 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
398 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
366 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  26.79 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
746 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 
254 aa  89.4  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
581 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.59 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.59 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.41 
 
 
326 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 
1035 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
326 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
334 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.8 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.19 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.17 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26.91 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>