163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1307 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
332 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  48.64 
 
 
330 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  48.34 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  48.36 
 
 
326 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  41.02 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  44.63 
 
 
324 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  42.59 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4611  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
327 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000220709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 
323 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
360 aa  205  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
329 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 
324 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  43.89 
 
 
356 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 
312 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  35.78 
 
 
327 aa  192  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
327 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  36.06 
 
 
325 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
327 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
342 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 
345 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
326 aa  185  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
345 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
345 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  33.43 
 
 
338 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  36.04 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
347 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
347 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  35.74 
 
 
332 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
347 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.24 
 
 
334 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  33.73 
 
 
327 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
332 aa  175  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  34.76 
 
 
345 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  36.28 
 
 
344 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  35.35 
 
 
334 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 
345 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 
345 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
342 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
323 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
330 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  34.14 
 
 
337 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
344 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  33.43 
 
 
327 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  35.97 
 
 
348 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  33.93 
 
 
330 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
355 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
330 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
345 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  34.13 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  34.55 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
330 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  33.53 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.45 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 
318 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  35.65 
 
 
337 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
328 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  31.45 
 
 
384 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  33.88 
 
 
338 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  35.35 
 
 
329 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  32.46 
 
 
371 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  32.23 
 
 
326 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
327 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  33.11 
 
 
417 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  32.52 
 
 
341 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  32.9 
 
 
340 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  32 
 
 
329 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  32.58 
 
 
340 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  32.66 
 
 
319 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  32.77 
 
 
340 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  32.66 
 
 
319 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  32.89 
 
 
340 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
340 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  32.24 
 
 
323 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  32.89 
 
 
340 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  36.16 
 
 
332 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  33.33 
 
 
340 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  33 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  32.57 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  32.55 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>