More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0736 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
537 aa  1050    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  51.01 
 
 
529 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  51.48 
 
 
538 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  52.24 
 
 
527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  46.63 
 
 
522 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4685  virulence factor MVIN family protein  34.28 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3967  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
540 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  31.87 
 
 
531 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 
613 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
523 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  27.24 
 
 
522 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.07 
 
 
521 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 
521 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.2 
 
 
522 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
521 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  28.22 
 
 
521 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 
534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  29.54 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.49 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  25.68 
 
 
521 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 
535 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 
525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 
522 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 
524 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  30.73 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.93 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.68 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  30.51 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  28.17 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  29.08 
 
 
512 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 
535 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
512 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 
521 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.93 
 
 
511 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 
533 aa  126  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
526 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  26.99 
 
 
512 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  27.43 
 
 
511 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 
524 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.05 
 
 
518 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.14 
 
 
512 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 
514 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
512 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
517 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 
519 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
517 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 
511 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.17 
 
 
511 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 
519 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  27.87 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.4 
 
 
522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  29.97 
 
 
517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  27.37 
 
 
523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  27.82 
 
 
523 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  26.24 
 
 
519 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 
521 aa  120  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  26.71 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  25.68 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  25.68 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  25.77 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.7 
 
 
511 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  29.02 
 
 
513 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.7 
 
 
511 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  26.99 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.15 
 
 
498 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.69 
 
 
541 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
519 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  25.43 
 
 
511 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 
519 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 
532 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 
521 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  25.59 
 
 
519 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 
514 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  24.18 
 
 
494 aa  117  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.82 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>