26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0469 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  100 
 
 		 487 aa  1006    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  41.12 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  42.35 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  40.24 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  40.41 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  38.62 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  37.62 
 
 		 518 aa  277  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  37.41 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  37.16 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  36.16 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  36.72 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  36.16 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  34.57 
 
 		 580 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  37.16 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  34.57 
 
 		 484 aa  236  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  35.62 
 
 		 457 aa  233  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  37.37 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  36.23 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  32.12 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  35.82 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  32.89 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  30.98 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  30.43 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  26.58 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  28.82 
 
 		 490 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>