More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3656 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3656  ATPase  100 
 
 
366 aa  738    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 
363 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  52.99 
 
 
363 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  54.08 
 
 
353 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 
363 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  53.44 
 
 
353 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.64 
 
 
354 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  53.13 
 
 
364 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  52.45 
 
 
365 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.78 
 
 
355 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.74 
 
 
353 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.62 
 
 
374 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.66 
 
 
370 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.27 
 
 
372 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 
360 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  55.46 
 
 
360 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.28 
 
 
358 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  52.08 
 
 
355 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.81 
 
 
370 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.43 
 
 
370 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  53.72 
 
 
360 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.07 
 
 
372 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
366 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  55.22 
 
 
362 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  51.52 
 
 
355 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.54 
 
 
366 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  51.65 
 
 
351 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.76 
 
 
361 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  51.25 
 
 
355 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
366 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  50.96 
 
 
352 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
366 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.09 
 
 
356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.78 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.73 
 
 
366 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.38 
 
 
370 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  51.47 
 
 
364 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.41 
 
 
369 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  51.87 
 
 
365 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  52.05 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  49.73 
 
 
365 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.73 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.96 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  49.73 
 
 
365 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.68 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.14 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.36 
 
 
360 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.41 
 
 
369 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.67 
 
 
352 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  50.4 
 
 
364 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
374 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  53.19 
 
 
357 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.59 
 
 
352 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  50.54 
 
 
360 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  50.54 
 
 
360 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  50.54 
 
 
360 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.54 
 
 
360 aa  352  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  49.72 
 
 
355 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.54 
 
 
360 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 
360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  50.54 
 
 
356 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.38 
 
 
367 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50 
 
 
355 aa  352  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.46 
 
 
351 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  49.45 
 
 
381 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.5 
 
 
367 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.68 
 
 
369 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  48.5 
 
 
367 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
360 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
364 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  50.42 
 
 
354 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.92 
 
 
384 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.12 
 
 
405 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  51.08 
 
 
585 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.18 
 
 
351 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  52.46 
 
 
356 aa  348  9e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.37 
 
 
369 aa  348  9e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
377 aa  347  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  50.81 
 
 
356 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.18 
 
 
351 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  49.05 
 
 
380 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
369 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.78 
 
 
365 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.76 
 
 
351 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  51.38 
 
 
357 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  50.97 
 
 
354 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.97 
 
 
355 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  50.97 
 
 
354 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.11 
 
 
367 aa  345  7e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>