More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2964 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
318 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.45 
 
 
325 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.9 
 
 
317 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.95 
 
 
318 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3093  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.04 
 
 
310 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2240  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.96 
 
 
310 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.862655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  55.33 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.33 
 
 
311 aa  335  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.96 
 
 
313 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  53.97 
 
 
313 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  52.67 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  53 
 
 
305 aa  318  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
311 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53 
 
 
312 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.18 
 
 
328 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.53 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  49.5 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  51.99 
 
 
312 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.8 
 
 
316 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.67 
 
 
311 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.67 
 
 
310 aa  309  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
315 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.82 
 
 
316 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  305  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.33 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
311 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  51.82 
 
 
320 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2836  aspartate carbamoyltransferase  52.61 
 
 
354 aa  302  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.37 
 
 
315 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.37 
 
 
315 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
316 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
317 aa  298  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.53 
 
 
313 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  51.85 
 
 
302 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.85 
 
 
323 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.67 
 
 
316 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.55 
 
 
331 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  51.67 
 
 
306 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  50.51 
 
 
311 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  48.31 
 
 
326 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
335 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
331 aa  295  9e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  48.23 
 
 
331 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
317 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  51.02 
 
 
310 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
313 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
317 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
313 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.51 
 
 
322 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
320 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.51 
 
 
322 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
316 aa  291  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.16 
 
 
309 aa  291  9e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  50.34 
 
 
306 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
320 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
320 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
317 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
324 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
318 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
362 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.67 
 
 
317 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2555  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  50.68 
 
 
309 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  45.13 
 
 
312 aa  288  6e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
323 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
322 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  48.49 
 
 
319 aa  288  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
317 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2039  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
309 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
323 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
318 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
317 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
323 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  47.91 
 
 
329 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.19 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.03 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  48.82 
 
 
312 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
307 aa  285  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
318 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
311 aa  285  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  47.88 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  49.05 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.49 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.18 
 
 
310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  49.67 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.68 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.49 
 
 
321 aa  282  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>