More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1871 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
318 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.86 
 
 
317 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.77 
 
 
325 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.95 
 
 
318 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2240  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.75 
 
 
310 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.862655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3093  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.34 
 
 
310 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  51.66 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
313 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52 
 
 
311 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.77 
 
 
316 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.67 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.5 
 
 
313 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.5 
 
 
313 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  52.16 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  50.99 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  52.32 
 
 
313 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
323 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
307 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
310 aa  298  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
311 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
312 aa  298  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
334 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
310 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
315 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
317 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
316 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  51.34 
 
 
313 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  47.51 
 
 
311 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.98 
 
 
316 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  48.77 
 
 
326 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
315 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
315 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  52.35 
 
 
302 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  52.49 
 
 
306 aa  295  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.68 
 
 
313 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  51.36 
 
 
310 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
316 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.7 
 
 
309 aa  292  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  49.33 
 
 
320 aa  291  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.18 
 
 
310 aa  291  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.33 
 
 
311 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
323 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
324 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  51.51 
 
 
306 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  50.66 
 
 
320 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
346 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
323 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
311 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
323 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  44.05 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.03 
 
 
323 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
317 aa  286  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
317 aa  285  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.06 
 
 
313 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  47.7 
 
 
319 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.53 
 
 
335 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
322 aa  285  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  48.87 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.87 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.54 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  48.76 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.54 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  48.37 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  49.84 
 
 
312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.87 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.39 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  47.87 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.76 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.01 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.7 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.7 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
361 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
361 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
361 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.19 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.67 
 
 
320 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
361 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
361 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
331 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
327 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
331 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.7 
 
 
341 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
316 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.7 
 
 
341 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  49.35 
 
 
331 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  48.22 
 
 
329 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
343 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>