More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_982 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  98.79 
 
 
331 aa  676    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  93.96 
 
 
331 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  100 
 
 
331 aa  683    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.05 
 
 
318 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.45 
 
 
318 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  54.49 
 
 
311 aa  349  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
312 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  53.67 
 
 
313 aa  346  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.07 
 
 
313 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  53.62 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  55.15 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  50.96 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.05 
 
 
318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.12 
 
 
308 aa  332  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
311 aa  328  9e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
313 aa  326  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  51.62 
 
 
316 aa  326  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  51.13 
 
 
312 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
310 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
311 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
311 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.46 
 
 
304 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  51.14 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
310 aa  319  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
310 aa  319  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.62 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  51.32 
 
 
305 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  50.97 
 
 
320 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  52.6 
 
 
313 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.88 
 
 
312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  51.47 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.53 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.53 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.53 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.46 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.53 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.51 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  49.19 
 
 
314 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
336 aa  301  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
334 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
334 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.57 
 
 
312 aa  296  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
334 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.08 
 
 
307 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
334 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.86 
 
 
317 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
334 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.23 
 
 
318 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
324 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
309 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
312 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  46.82 
 
 
326 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.44 
 
 
317 aa  292  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.41 
 
 
324 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
334 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.6 
 
 
310 aa  292  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.54 
 
 
328 aa  291  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
334 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.08 
 
 
323 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.87 
 
 
338 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.3 
 
 
317 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.83 
 
 
323 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  47.67 
 
 
310 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  47.02 
 
 
329 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
320 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
317 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
336 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
323 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.83 
 
 
323 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.54 
 
 
318 aa  289  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.57 
 
 
323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  47.87 
 
 
333 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  47.56 
 
 
313 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.18 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
328 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
325 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
315 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.68 
 
 
331 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.18 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
316 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
315 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
315 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.27 
 
 
323 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.02 
 
 
333 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.53 
 
 
321 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  48.21 
 
 
311 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  49.34 
 
 
312 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.77 
 
 
343 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.1 
 
 
346 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.77 
 
 
343 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.77 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.03 
 
 
316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.77 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  46.65 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.45 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>