More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2401 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
328 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  80.45 
 
 
313 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.11 
 
 
324 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.94 
 
 
323 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  81.14 
 
 
310 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  76.68 
 
 
311 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.69 
 
 
318 aa  481  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.15 
 
 
309 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  77.56 
 
 
302 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  78.03 
 
 
312 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  76.95 
 
 
306 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  75.88 
 
 
332 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.59 
 
 
313 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  75.74 
 
 
309 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.17 
 
 
323 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  70.03 
 
 
349 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  71.88 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  70.18 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  69.51 
 
 
333 aa  435  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 
308 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  71.2 
 
 
320 aa  428  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 
308 aa  428  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.35 
 
 
342 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  68.34 
 
 
327 aa  421  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.31 
 
 
319 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.09 
 
 
337 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  69.28 
 
 
310 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.63 
 
 
316 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.63 
 
 
316 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.63 
 
 
316 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.48 
 
 
315 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  64.76 
 
 
316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.52 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  65.61 
 
 
318 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  66.02 
 
 
311 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  59.74 
 
 
319 aa  345  7e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.13 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  55.85 
 
 
320 aa  332  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  55.26 
 
 
313 aa  328  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  57 
 
 
320 aa  325  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.64 
 
 
324 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
316 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.27 
 
 
313 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.33 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  51.64 
 
 
311 aa  320  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.63 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.51 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
315 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
307 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
315 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.79 
 
 
313 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  54 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  50.96 
 
 
314 aa  319  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.79 
 
 
313 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.3 
 
 
336 aa  318  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.79 
 
 
313 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.85 
 
 
317 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  53.14 
 
 
316 aa  318  7e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
310 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
334 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.09 
 
 
311 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
310 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.85 
 
 
315 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
336 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  52.92 
 
 
312 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.19 
 
 
321 aa  315  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.18 
 
 
318 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  51.96 
 
 
334 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52 
 
 
308 aa  315  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  54.64 
 
 
306 aa  315  8e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  54.25 
 
 
309 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.92 
 
 
318 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.96 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.64 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.51 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.96 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.52 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.47 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.67 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.76 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.1 
 
 
317 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.97 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  53.5 
 
 
314 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.48 
 
 
311 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
316 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
313 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
316 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.13 
 
 
318 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
334 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.51 
 
 
323 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.7 
 
 
335 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.67 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
317 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
317 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.51 
 
 
328 aa  309  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.51 
 
 
323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>