More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5245 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
311 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  85.11 
 
 
310 aa  518  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  73.31 
 
 
315 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.35 
 
 
315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.81 
 
 
316 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.48 
 
 
316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  74.59 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.48 
 
 
316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.94 
 
 
319 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  72.29 
 
 
318 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  67.87 
 
 
309 aa  397  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  68.32 
 
 
306 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.43 
 
 
313 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.02 
 
 
328 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  65.15 
 
 
313 aa  391  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.09 
 
 
323 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  65.58 
 
 
312 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  66.12 
 
 
302 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.46 
 
 
309 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.81 
 
 
324 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  65.44 
 
 
310 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  63.84 
 
 
311 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.69 
 
 
318 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.5 
 
 
308 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.98 
 
 
323 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.17 
 
 
308 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  63.24 
 
 
351 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  61.66 
 
 
335 aa  362  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  62.54 
 
 
332 aa  361  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  59.94 
 
 
349 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  60 
 
 
333 aa  358  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.63 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.5 
 
 
342 aa  355  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  59.76 
 
 
327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  60.19 
 
 
320 aa  335  5e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  59.03 
 
 
319 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  55.23 
 
 
312 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  55.92 
 
 
306 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
307 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.78 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  53 
 
 
313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.64 
 
 
317 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.32 
 
 
325 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.87 
 
 
311 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  53.44 
 
 
314 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  53.25 
 
 
329 aa  291  8e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
310 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
306 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  54.13 
 
 
319 aa  288  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  49.5 
 
 
307 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  51.63 
 
 
313 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
313 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  50.67 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  54 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.82 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
323 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.92 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.92 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.47 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.29 
 
 
313 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
323 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
307 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.58 
 
 
335 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 
310 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
322 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
316 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
346 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
313 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.33 
 
 
315 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
317 aa  279  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 
310 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
313 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
323 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
322 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
322 aa  279  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
318 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
318 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
317 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.96 
 
 
312 aa  278  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
323 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
313 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
315 aa  278  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  51.13 
 
 
326 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
343 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
341 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.61 
 
 
318 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  47.19 
 
 
312 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.16 
 
 
317 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
343 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
311 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.61 
 
 
318 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>