More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2512 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
314 aa  641    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
313 aa  349  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.66 
 
 
313 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.15 
 
 
307 aa  348  7e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  56.15 
 
 
312 aa  347  1e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  53.92 
 
 
311 aa  345  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  56.25 
 
 
316 aa  340  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
310 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  55.59 
 
 
313 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.75 
 
 
307 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.37 
 
 
306 aa  338  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  52.61 
 
 
313 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  55.15 
 
 
306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.1 
 
 
313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.1 
 
 
313 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  52.86 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  55.23 
 
 
320 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  54.25 
 
 
312 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  53.69 
 
 
307 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
308 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  54.72 
 
 
312 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.75 
 
 
311 aa  328  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
310 aa  328  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  54.3 
 
 
309 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.79 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
310 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.27 
 
 
310 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  52.32 
 
 
313 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
324 aa  322  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.27 
 
 
310 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  54.49 
 
 
305 aa  322  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.98 
 
 
311 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  52.49 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  53.18 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.96 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.01 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
334 aa  318  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  51.97 
 
 
306 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  50.49 
 
 
313 aa  317  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
311 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  53.49 
 
 
302 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.15 
 
 
318 aa  315  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.97 
 
 
334 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.44 
 
 
308 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.97 
 
 
334 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  50.49 
 
 
312 aa  315  9e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  53.55 
 
 
329 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  51.75 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.97 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.64 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.64 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.64 
 
 
312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  51.32 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.3 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.4 
 
 
328 aa  311  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  52.22 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53 
 
 
323 aa  311  9e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
317 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  51.43 
 
 
332 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.32 
 
 
317 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
321 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.67 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
320 aa  308  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  50.78 
 
 
333 aa  308  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
318 aa  308  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.62 
 
 
318 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  51.22 
 
 
349 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  51.31 
 
 
309 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.64 
 
 
308 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.45 
 
 
328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.48 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.15 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  49.67 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  49.19 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.55 
 
 
331 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  49.54 
 
 
331 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
343 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1380  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
320 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2409  aspartate carbamoyltransferase  50.33 
 
 
340 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.891458  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
343 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.93 
 
 
333 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
343 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
320 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.64 
 
 
346 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
336 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
331 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
361 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
361 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.46 
 
 
323 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
361 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
361 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>