More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0370 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.11 
 
 
307 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.37 
 
 
313 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  61.46 
 
 
311 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  62.38 
 
 
312 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  57.89 
 
 
313 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  62.5 
 
 
306 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  60.46 
 
 
313 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.17 
 
 
312 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  56.44 
 
 
313 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  57.98 
 
 
312 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.37 
 
 
313 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  58.75 
 
 
305 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
311 aa  361  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  62.21 
 
 
320 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.59 
 
 
304 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.97 
 
 
311 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.67 
 
 
310 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.96 
 
 
311 aa  349  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  55.95 
 
 
326 aa  346  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.05 
 
 
312 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  55.03 
 
 
312 aa  345  8e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.69 
 
 
308 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.31 
 
 
310 aa  340  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.19 
 
 
317 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.97 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.28 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
316 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  53.62 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.62 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.97 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.29 
 
 
315 aa  335  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.61 
 
 
316 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.52 
 
 
316 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
305 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.3 
 
 
331 aa  330  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.9 
 
 
309 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
313 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.59 
 
 
318 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.63 
 
 
313 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.95 
 
 
310 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.63 
 
 
313 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  54.3 
 
 
314 aa  328  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.3 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.3 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  53.36 
 
 
315 aa  326  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.67 
 
 
318 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.73 
 
 
316 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.28 
 
 
334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.26 
 
 
317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.69 
 
 
307 aa  325  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.67 
 
 
318 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  50.84 
 
 
309 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.07 
 
 
321 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  54.67 
 
 
319 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.67 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  54.28 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.08 
 
 
315 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  54.69 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  54.64 
 
 
333 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
320 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
320 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.14 
 
 
317 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.33 
 
 
319 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  55.3 
 
 
302 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.96 
 
 
320 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
318 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.42 
 
 
311 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  55.15 
 
 
313 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
309 aa  316  4e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.14 
 
 
317 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.75 
 
 
308 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.25 
 
 
328 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  55.3 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  53.68 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
308 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2039  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.19 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.48 
 
 
362 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
307 aa  311  7.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
334 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.15 
 
 
338 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
336 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.58 
 
 
323 aa  310  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  54.36 
 
 
316 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  54.73 
 
 
310 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.6 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.67 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.18 
 
 
313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.67 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.67 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.29 
 
 
317 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.33 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  48.36 
 
 
312 aa  308  9e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>