More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0084 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  81.91 
 
 
306 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  82.95 
 
 
307 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.38 
 
 
310 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.39 
 
 
308 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.38 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  76.72 
 
 
309 aa  484  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  73.77 
 
 
313 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  59.74 
 
 
320 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  56.48 
 
 
311 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.94 
 
 
311 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.58 
 
 
313 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  56.15 
 
 
313 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.95 
 
 
311 aa  348  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  55.15 
 
 
314 aa  348  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  58.47 
 
 
312 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.59 
 
 
307 aa  346  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.82 
 
 
312 aa  344  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  54.52 
 
 
315 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  54.46 
 
 
312 aa  339  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.64 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.64 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  55.15 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
316 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  55.37 
 
 
305 aa  335  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
323 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
313 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
313 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  54.33 
 
 
311 aa  332  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  54.61 
 
 
313 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  51.17 
 
 
313 aa  331  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  51.83 
 
 
306 aa  331  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
313 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.3 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  53.72 
 
 
326 aa  325  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  53.69 
 
 
309 aa  325  7e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.67 
 
 
311 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
311 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
324 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
309 aa  321  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.33 
 
 
312 aa  321  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  51.19 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  52.33 
 
 
306 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.67 
 
 
310 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
308 aa  316  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  51.15 
 
 
313 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.51 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
302 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  49.66 
 
 
312 aa  312  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  53.29 
 
 
329 aa  311  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
313 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
308 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.19 
 
 
304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.35 
 
 
315 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  48.52 
 
 
316 aa  309  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
315 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
315 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.34 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.68 
 
 
316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
313 aa  305  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.35 
 
 
317 aa  305  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.01 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  48.88 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
337 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  51.17 
 
 
306 aa  301  9e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  48.5 
 
 
320 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.01 
 
 
318 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.41 
 
 
331 aa  298  5e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  47.35 
 
 
331 aa  298  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
342 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3093  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
310 aa  298  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  53.49 
 
 
314 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
313 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
318 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  46.08 
 
 
331 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  50.66 
 
 
319 aa  296  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.69 
 
 
319 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.44 
 
 
331 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.49 
 
 
305 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51 
 
 
321 aa  295  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
308 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  50.67 
 
 
312 aa  295  9e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2055  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
311 aa  294  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
312 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.64 
 
 
309 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.1 
 
 
331 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
317 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
308 aa  293  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
327 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
327 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
315 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
317 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.76 
 
 
338 aa  292  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>