More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0541 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  53.4 
 
 
311 aa  326  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  54.7 
 
 
312 aa  324  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  55.78 
 
 
313 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.36 
 
 
312 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.84 
 
 
306 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.7 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
313 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
307 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
311 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  50.34 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.01 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
305 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
312 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.17 
 
 
307 aa  301  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  48.99 
 
 
305 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
316 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
310 aa  298  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
310 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.34 
 
 
304 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.01 
 
 
310 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  48.99 
 
 
311 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51 
 
 
308 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.01 
 
 
310 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  50.5 
 
 
312 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  51.86 
 
 
312 aa  294  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
315 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  48.16 
 
 
302 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
311 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.49 
 
 
311 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
315 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.83 
 
 
309 aa  292  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
328 aa  292  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.32 
 
 
308 aa  291  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
307 aa  291  7e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
315 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
315 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  45.51 
 
 
315 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52 
 
 
310 aa  290  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.66 
 
 
313 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.66 
 
 
316 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.66 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  48.64 
 
 
310 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.82 
 
 
309 aa  288  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  47.39 
 
 
326 aa  287  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  47.32 
 
 
313 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.32 
 
 
334 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.32 
 
 
316 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3093  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.64 
 
 
310 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  48.67 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  46.15 
 
 
306 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  47.21 
 
 
320 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.16 
 
 
323 aa  285  9e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2039  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.16 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  46.93 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2240  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.49 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.862655 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.62 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.65 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.67 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  49.01 
 
 
313 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
344 aa  281  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  46 
 
 
309 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  45.95 
 
 
309 aa  280  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.49 
 
 
309 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.01 
 
 
321 aa  281  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  47.1 
 
 
314 aa  280  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
317 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.78 
 
 
315 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.49 
 
 
321 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.98 
 
 
362 aa  279  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  45.36 
 
 
316 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.32 
 
 
324 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.66 
 
 
319 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.3 
 
 
307 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  45.82 
 
 
306 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  47.39 
 
 
333 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
341 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
318 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.18 
 
 
308 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.63 
 
 
318 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.65 
 
 
336 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.54 
 
 
311 aa  276  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  46.49 
 
 
320 aa  276  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.82 
 
 
331 aa  275  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.23 
 
 
324 aa  275  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  44.48 
 
 
331 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
318 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  47.8 
 
 
314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0112  aspartate carbamoyltransferase  48.33 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3070  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.15 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.87496  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.44 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  46.49 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>