More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2055 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2055  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
311 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545936  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.08 
 
 
311 aa  518  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0492  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.64 
 
 
301 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0142904  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.82 
 
 
308 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1788  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.1 
 
 
308 aa  488  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000240723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.99 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00166566  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1646  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.68 
 
 
312 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108455  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  50.32 
 
 
307 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
306 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  51.32 
 
 
320 aa  295  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  51.15 
 
 
312 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 
307 aa  292  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
313 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  46.91 
 
 
309 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
312 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  48.17 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  47.57 
 
 
311 aa  285  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
312 aa  285  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.56 
 
 
312 aa  285  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  48.17 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.37 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.27 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.9 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
304 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
313 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  48.04 
 
 
306 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.87 
 
 
328 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
313 aa  278  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.27 
 
 
315 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.01 
 
 
311 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  46.62 
 
 
306 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  49.01 
 
 
313 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
311 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 
308 aa  276  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
344 aa  275  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.45 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  51.67 
 
 
313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.73 
 
 
318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.63 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.63 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  48.34 
 
 
313 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.41 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
312 aa  269  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.43 
 
 
328 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  46.38 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  268  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  46.41 
 
 
312 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  47.57 
 
 
310 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  46.98 
 
 
319 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.23 
 
 
317 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  46.89 
 
 
306 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
313 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.93 
 
 
318 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.56 
 
 
313 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
318 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.39 
 
 
316 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.39 
 
 
316 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.56 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
316 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
316 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
305 aa  265  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.06 
 
 
316 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.45 
 
 
334 aa  265  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
323 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
323 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.98 
 
 
317 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.9 
 
 
316 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  47.54 
 
 
311 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  47.44 
 
 
329 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
327 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
327 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.27 
 
 
323 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
317 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.81 
 
 
313 aa  262  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.89 
 
 
308 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.21 
 
 
308 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.27 
 
 
323 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 
346 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  45.89 
 
 
318 aa  261  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  44.95 
 
 
309 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
334 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.39 
 
 
312 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
334 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  46.67 
 
 
310 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.69 
 
 
343 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  45.39 
 
 
319 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.28 
 
 
321 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.69 
 
 
343 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.83 
 
 
324 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 
341 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 
341 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.69 
 
 
343 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>