More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3093 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3093  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
310 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2240  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.9 
 
 
310 aa  474  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.862655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.1 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.04 
 
 
318 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.73 
 
 
325 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.34 
 
 
318 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  54.15 
 
 
313 aa  328  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
311 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
313 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  53.82 
 
 
305 aa  322  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  53.77 
 
 
313 aa  318  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  51.83 
 
 
311 aa  317  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
310 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.82 
 
 
312 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  53.49 
 
 
312 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.16 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  51.61 
 
 
320 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
307 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  52.51 
 
 
320 aa  308  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.5 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  52.01 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  49.68 
 
 
326 aa  300  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
316 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.35 
 
 
323 aa  299  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
307 aa  298  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.5 
 
 
310 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  50.98 
 
 
309 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  51.17 
 
 
306 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.87 
 
 
312 aa  294  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
313 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.66 
 
 
313 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
313 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2836  aspartate carbamoyltransferase  52.68 
 
 
354 aa  291  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  51.19 
 
 
310 aa  291  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
316 aa  291  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  291  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.34 
 
 
313 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
332 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  50.67 
 
 
313 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
317 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
324 aa  288  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
323 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
315 aa  288  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.67 
 
 
308 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.18 
 
 
306 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.49 
 
 
316 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.84 
 
 
310 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
313 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.35 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  48.51 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  48.64 
 
 
306 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.83 
 
 
317 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  47 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.68 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
319 aa  282  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
323 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
320 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.17 
 
 
318 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
320 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
306 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.81 
 
 
334 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
316 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  46.84 
 
 
307 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  44 
 
 
309 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  47.68 
 
 
333 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
343 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  49.84 
 
 
351 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48 
 
 
335 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
343 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
323 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  48.77 
 
 
349 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.22 
 
 
321 aa  279  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  48.85 
 
 
329 aa  279  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.81 
 
 
316 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 
315 aa  278  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
343 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 
315 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
343 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
343 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
343 aa  278  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.18 
 
 
315 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.84 
 
 
318 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
323 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.47 
 
 
317 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  49 
 
 
312 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 
336 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.23 
 
 
341 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
346 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.5 
 
 
314 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>