More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0867 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.71 
 
 
343 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
361 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
361 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
361 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
343 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
343 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.71 
 
 
381 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.42 
 
 
343 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
361 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.34 
 
 
343 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.42 
 
 
343 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  92.65 
 
 
341 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
343 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.42 
 
 
343 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  95.63 
 
 
361 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
343 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  93.81 
 
 
346 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  92.94 
 
 
341 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  91.48 
 
 
323 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  90.85 
 
 
323 aa  590  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.68 
 
 
323 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.68 
 
 
323 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.68 
 
 
323 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  83.17 
 
 
320 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  81.59 
 
 
320 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  81.59 
 
 
320 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  81.27 
 
 
320 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  82.11 
 
 
320 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.76 
 
 
319 aa  524  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.19 
 
 
320 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.44 
 
 
320 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.75 
 
 
320 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1380  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80 
 
 
320 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  81.47 
 
 
323 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.816603  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.51 
 
 
317 aa  511  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.23 
 
 
320 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3698  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.75 
 
 
319 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.48 
 
 
317 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.27 
 
 
316 aa  494  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0267  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.88 
 
 
322 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.2 
 
 
326 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.71 
 
 
336 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.83 
 
 
334 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.16 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.53 
 
 
335 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.4 
 
 
336 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.78 
 
 
334 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  67.21 
 
 
333 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.08 
 
 
334 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.4 
 
 
328 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  67.75 
 
 
334 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.08 
 
 
334 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.08 
 
 
334 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.08 
 
 
334 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.75 
 
 
334 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.67 
 
 
324 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.56 
 
 
321 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.78 
 
 
334 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2409  aspartate carbamoyltransferase  65.93 
 
 
340 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.891458  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
328 aa  418  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1829  aspartate carbamoyltransferase  63.38 
 
 
339 aa  411  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.87 
 
 
336 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.06 
 
 
327 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.06 
 
 
327 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.43 
 
 
362 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315008  hitchhiker  0.000272869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0531  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.58 
 
 
357 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0103229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.58 
 
 
357 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  57.28 
 
 
313 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  57 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.24 
 
 
317 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  57.57 
 
 
329 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.78 
 
 
311 aa  328  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.87 
 
 
313 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.12 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.45 
 
 
315 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
317 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
334 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.12 
 
 
316 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.8 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.13 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.46 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.13 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.55 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
316 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.48 
 
 
316 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.11 
 
 
321 aa  318  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.13 
 
 
362 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.88 
 
 
318 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.3 
 
 
316 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.21 
 
 
318 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.22 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.74 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2555  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.22 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.45 
 
 
317 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  51.66 
 
 
312 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.22 
 
 
322 aa  311  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.22 
 
 
322 aa  311  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
317 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  52.4 
 
 
326 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>