More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3005 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
323 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  76.76 
 
 
335 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  74.92 
 
 
349 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  76.99 
 
 
351 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  76.19 
 
 
313 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  76.16 
 
 
332 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.19 
 
 
323 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.17 
 
 
328 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.56 
 
 
324 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  73.95 
 
 
311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  71.56 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  76.32 
 
 
310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.83 
 
 
342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  75.32 
 
 
306 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.59 
 
 
337 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.47 
 
 
313 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  72.12 
 
 
302 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  71.21 
 
 
327 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  72.24 
 
 
309 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.75 
 
 
318 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  71.88 
 
 
320 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  71.29 
 
 
312 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.47 
 
 
309 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.84 
 
 
308 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.89 
 
 
308 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  67.51 
 
 
310 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.89 
 
 
315 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.66 
 
 
319 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.3 
 
 
316 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.3 
 
 
316 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.3 
 
 
316 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.64 
 
 
315 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  63.27 
 
 
318 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  62.38 
 
 
316 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  62.46 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  64.98 
 
 
311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  55.77 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.37 
 
 
313 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.61 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.42 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.1 
 
 
336 aa  308  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  55.21 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.29 
 
 
308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.66 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.6 
 
 
334 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  55.77 
 
 
320 aa  305  6e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.13 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.9 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.56 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  53.82 
 
 
329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.23 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.9 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
306 aa  301  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  49.36 
 
 
311 aa  301  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.84 
 
 
316 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.55 
 
 
318 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  50.49 
 
 
307 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
311 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  54.49 
 
 
309 aa  299  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.24 
 
 
323 aa  299  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
341 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  52.24 
 
 
313 aa  298  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.26 
 
 
343 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
315 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
341 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
315 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.59 
 
 
311 aa  298  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
315 aa  298  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.26 
 
 
343 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.26 
 
 
343 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.24 
 
 
323 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
311 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.1 
 
 
336 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.26 
 
 
343 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.69 
 
 
317 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
310 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.26 
 
 
381 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.24 
 
 
323 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  54.73 
 
 
312 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
310 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  53.9 
 
 
320 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.5 
 
 
313 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.24 
 
 
323 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
307 aa  295  5e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
343 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
343 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.92 
 
 
317 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.53 
 
 
324 aa  295  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.41 
 
 
317 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.24 
 
 
323 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.69 
 
 
335 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.53 
 
 
334 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
308 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.53 
 
 
313 aa  292  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>