More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2585 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
318 aa  634    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.97 
 
 
315 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.32 
 
 
315 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  83.28 
 
 
316 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  82.96 
 
 
316 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  82.96 
 
 
316 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.99 
 
 
319 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  79.42 
 
 
316 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  73.25 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  72.29 
 
 
311 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  64.15 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  65.41 
 
 
312 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.61 
 
 
328 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  65.59 
 
 
306 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.45 
 
 
313 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.38 
 
 
309 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  64.56 
 
 
309 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.78 
 
 
323 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  64.05 
 
 
310 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  63.23 
 
 
302 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.62 
 
 
318 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.77 
 
 
324 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  61.95 
 
 
311 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.1 
 
 
308 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.27 
 
 
323 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.1 
 
 
308 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  61.49 
 
 
332 aa  358  9e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  59.47 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  61.59 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  56.6 
 
 
349 aa  344  8.999999999999999e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  56.85 
 
 
333 aa  342  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  58.56 
 
 
327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  57.96 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  56.66 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.06 
 
 
342 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.76 
 
 
337 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  53.55 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  53.25 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  50.98 
 
 
313 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.25 
 
 
312 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
315 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.73 
 
 
313 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
315 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
315 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
307 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.76 
 
 
310 aa  295  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
314 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.64 
 
 
318 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.74 
 
 
310 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.74 
 
 
310 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.12 
 
 
307 aa  291  7e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.58 
 
 
311 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.35 
 
 
312 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.47 
 
 
325 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
334 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.63 
 
 
317 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.05 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.1 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  45.51 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  46.6 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  47.57 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.61 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
320 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
320 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  51.46 
 
 
314 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
316 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.6 
 
 
311 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.82 
 
 
312 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.63 
 
 
317 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
318 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.47 
 
 
306 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  51.96 
 
 
320 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.13 
 
 
313 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  49.03 
 
 
320 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
323 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.74 
 
 
321 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.81 
 
 
310 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.9 
 
 
322 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.74 
 
 
316 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
334 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.78 
 
 
318 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.87 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.31 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.14 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  51.27 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  49.19 
 
 
334 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.68 
 
 
308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.46 
 
 
318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  45.51 
 
 
307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  47.39 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.67 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.57 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>