More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  85.11 
 
 
311 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.44 
 
 
315 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.56 
 
 
316 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.88 
 
 
316 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.56 
 
 
316 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.79 
 
 
315 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.88 
 
 
319 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  73.38 
 
 
316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  73.25 
 
 
318 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.28 
 
 
328 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  69.51 
 
 
309 aa  417  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  67.76 
 
 
313 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  68.42 
 
 
306 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.16 
 
 
323 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  68.85 
 
 
302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.78 
 
 
309 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  67.21 
 
 
312 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.2 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.02 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  66.12 
 
 
311 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  67.34 
 
 
310 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.48 
 
 
308 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.77 
 
 
308 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.51 
 
 
323 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.59 
 
 
324 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  64.87 
 
 
332 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  61.08 
 
 
349 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  62.57 
 
 
351 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.99 
 
 
342 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  59.94 
 
 
333 aa  362  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.37 
 
 
337 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  62.1 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  60.67 
 
 
335 aa  355  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  59.76 
 
 
327 aa  349  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  58.9 
 
 
319 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  56.07 
 
 
312 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  57.05 
 
 
306 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  54.25 
 
 
313 aa  315  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.77 
 
 
313 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.97 
 
 
312 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.28 
 
 
307 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.67 
 
 
312 aa  305  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  53.42 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  55.06 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  49.51 
 
 
311 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  54.61 
 
 
313 aa  301  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.98 
 
 
310 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
310 aa  299  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.3 
 
 
317 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.98 
 
 
310 aa  299  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.45 
 
 
311 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
336 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.42 
 
 
313 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
315 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.97 
 
 
315 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.97 
 
 
315 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
313 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
318 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
335 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.5 
 
 
312 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
318 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.3 
 
 
316 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.9 
 
 
318 aa  291  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
308 aa  292  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.69 
 
 
306 aa  292  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.97 
 
 
315 aa  291  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.38 
 
 
311 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  53.75 
 
 
320 aa  290  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.47 
 
 
318 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.92 
 
 
317 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  51.3 
 
 
314 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
322 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.98 
 
 
317 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.03 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  54 
 
 
319 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  52.96 
 
 
314 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.46 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  49.01 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
321 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.3 
 
 
316 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.33 
 
 
324 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
311 aa  288  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
323 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.3 
 
 
317 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.16 
 
 
323 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
322 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
322 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.33 
 
 
341 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  49.02 
 
 
313 aa  286  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.69 
 
 
307 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.33 
 
 
346 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.34 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.33 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
313 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
313 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.78 
 
 
317 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>