More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2248 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  176  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  86.36 
 
 		 88 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  82.95 
 
 		 88 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  83.72 
 
 		 87 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  71.59 
 
 		 88 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  67.05 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  59.09 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  61.04 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  58.33 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  62.96 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  60.53 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  62.67 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  59.46 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  53.09 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 85 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  52.87 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 85 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  55.17 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  54.76 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  53.41 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 87 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  53.26 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  56.32 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  62.5 
 
 		 80 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  57.14 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  54.74 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  61.76 
 
 		 80 aa  87.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  55.13 
 
 		 88 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  61.76 
 
 		 80 aa  87.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  49.4 
 
 		 85 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  61.76 
 
 		 80 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  51.14 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  59.72 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  53.85 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>