82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0483 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0483  ATPase  100 
 
 
327 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.44 
 
 
327 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.79 
 
 
330 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  47.99 
 
 
332 aa  288  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  47.08 
 
 
332 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  41.09 
 
 
331 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  42.65 
 
 
347 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  42.69 
 
 
348 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  41.72 
 
 
348 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  46.4 
 
 
340 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  39.88 
 
 
342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.02 
 
 
347 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.93 
 
 
347 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  37.92 
 
 
341 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  34.22 
 
 
334 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  36.14 
 
 
379 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.85 
 
 
364 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  35.69 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  35.69 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.8 
 
 
354 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  38.01 
 
 
368 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  37.83 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  37.78 
 
 
353 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  35.5 
 
 
369 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  36.05 
 
 
369 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  32.72 
 
 
369 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  34.93 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  35.92 
 
 
414 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  35.42 
 
 
379 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  35.42 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  33.92 
 
 
364 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.58 
 
 
414 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  35.82 
 
 
372 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.34 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  29.69 
 
 
360 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.88 
 
 
418 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.97 
 
 
372 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.57 
 
 
367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  38.75 
 
 
369 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  32.3 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.53 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  31.91 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.04 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.53 
 
 
398 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  29.29 
 
 
352 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  30.65 
 
 
368 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  31.54 
 
 
368 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  31.54 
 
 
368 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  29.2 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  24.8 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  25.29 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.81 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.21 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  28.01 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  26.37 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  27.67 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.02 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  23.94 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26.04 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.5 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  22.63 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  24.17 
 
 
505 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  29.58 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  29.83 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  27.54 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  27.16 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  27.13 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  23.66 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  26.38 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.43 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  25 
 
 
337 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  27.91 
 
 
272 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  24 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.68 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.37 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.47 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  29.89 
 
 
437 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.37 
 
 
336 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  28.66 
 
 
272 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1072  recombination factor protein RarA  29.55 
 
 
123 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.657739  normal  0.0829774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  27.04 
 
 
317 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  25.83 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>