More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2297 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
219 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.61 
 
 
220 aa  358  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.04 
 
 
219 aa  336  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.67 
 
 
219 aa  322  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.76 
 
 
219 aa  307  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.56 
 
 
219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0620  ABC transporter integral membrane protein  82.65 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0566  ABC transporter integral membrane protein  82.65 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0576  ABC transporter integral membrane protein  82.65 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.332702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0559  ABC transporter integral membrane protein  82.65 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0561  ABC transporter integral membrane protein  82.65 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  49.05 
 
 
218 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 
218 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  49.52 
 
 
225 aa  188  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  44.25 
 
 
226 aa  188  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.87 
 
 
221 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
225 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  51.61 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 
217 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 
217 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.7 
 
 
213 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  47.37 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  47.85 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 
223 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  48.17 
 
 
224 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 
224 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 
215 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  48.04 
 
 
225 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  50.5 
 
 
228 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.32 
 
 
225 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
221 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.48 
 
 
223 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
221 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.17 
 
 
224 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  48.17 
 
 
224 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
218 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.58 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.69 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.16 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.58 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.34 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  46.82 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  46.82 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.29 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
221 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.16 
 
 
217 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 
217 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.3 
 
 
221 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  50.69 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  50.69 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
224 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  45.83 
 
 
217 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
227 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  45.83 
 
 
217 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 
225 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
227 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
227 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.85 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  48.51 
 
 
222 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  48.51 
 
 
222 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  48.51 
 
 
222 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
222 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  48.51 
 
 
222 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
227 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.3 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 
221 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.11 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  43.72 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
217 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  50.46 
 
 
217 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 
246 aa  161  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.5 
 
 
214 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>