27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2111 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  100 
 
 		 163 aa  341  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  81.6 
 
 		 163 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  73.29 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  73.42 
 
 		 165 aa  248  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  59.09 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  52.47 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  53.95 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  52.5 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  53.29 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  53.29 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  51.61 
 
 		 158 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  51.59 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  47.95 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  47.02 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  40.88 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  38.19 
 
 		 630 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  33.99 
 
 		 274 aa  80.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  47.57 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  35.76 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  53.12 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  28.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  29.17 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  46.84 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  28.48 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  29.94 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  28.21 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>