32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0483 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  83.86 
 
 		 502 aa  866    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  84.26 
 
 		 502 aa  872    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  89.84 
 
 		 502 aa  907    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 502 aa  1024    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  66.13 
 
 		 516 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  64.31 
 
 		 504 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  38.92 
 
 		 552 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  39.29 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  38.29 
 
 		 595 aa  355  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  38.29 
 
 		 600 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  37.8 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  38.52 
 
 		 526 aa  350  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  38.83 
 
 		 515 aa  335  9e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  38.62 
 
 		 609 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  32.87 
 
 		 502 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  32.34 
 
 		 746 aa  262  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  33.19 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 		 454 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  30.23 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.77 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  32.37 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.6 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 972 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>