More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1641 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1641  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 357 aa  733    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1610  transcriptional regulator, LacI family  77.81 
 
 		 356 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2628  transcriptional regulator, LacI family  65.73 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2354  transcriptional regulator, LacI family  65.73 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1314  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  59.83 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3600  LacI family transcription regulator  58.22 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  normal  0.188315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0979  LacI family transcription regulator  57.48 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0927  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  57.48 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3362  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  57.48 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03519  putative transcriptional regulator  53.93 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03470  hypothetical protein  53.93 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0717  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  32.47 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.71 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.71 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.71 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.71 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.71 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  26.71 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.71 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.71 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  27.25 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.2 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.14 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 345 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4007  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.94 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  25.72 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4336  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563264  hitchhiker  0.000141472 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  26.58 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.39 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  26.63 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  27.97 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.49 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.74 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  28.06 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  26.63 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.88 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  29.28 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.22 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.22 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.22 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.22 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.22 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.57 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.18 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.3 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.98 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.18 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.63 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.32 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.49 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  27.61 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  24.78 
 
 		 332 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  27.33 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  28.3 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  28.02 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  27.27 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  24.2 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  29.06 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  25.8 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  27.62 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  24.2 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  24.2 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  26.19 
 
 		 330 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  26.19 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  26.19 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.33 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  26.19 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.06 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.33 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  27.35 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  24.34 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.33 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.3 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>