73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1141 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  199  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  74.49 
 
 
93 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  74.49 
 
 
105 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  74.49 
 
 
93 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  74.49 
 
 
93 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  71.43 
 
 
93 aa  146  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  70.41 
 
 
108 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  71.43 
 
 
93 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  70.41 
 
 
98 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  71.88 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  69.79 
 
 
94 aa  137  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1484  hypothetical protein  84.93 
 
 
108 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  83.56 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  70.83 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  83.1 
 
 
94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  83.1 
 
 
94 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  81.43 
 
 
91 aa  124  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  81.43 
 
 
91 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  81.69 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  65.28 
 
 
77 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3841  putative transcriptional regulator  59.68 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0580  hypothetical protein  53.62 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282909  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2797  hypothetical protein  54.41 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.160202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1488  hypothetical protein  60.66 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3075  putative transcriptional regulator  50 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0760  hypothetical protein  50.67 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.629902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0365  hypothetical protein  49.32 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3016  putative transcriptional regulator  48.75 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  54.84 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4016  hypothetical protein  54.84 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.111563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2867  putative transcriptional regulator  48.75 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1205  putative transcriptional regulator  50.72 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3530  hypothetical protein  50.72 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178244  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3682  hypothetical protein  52.17 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3183  putative transcriptional regulator  53.23 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3816  putative transcriptional regulator  56.45 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3178  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2495  putative transcriptional regulator  49.3 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1513  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7730  hypothetical protein  54.84 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3346  hypothetical protein  53.97 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599025  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3909  putative transcriptional regulator  54.84 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0183  hypothetical protein  48.44 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0524  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2625  hypothetical protein  54.29 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  51.72 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  50.77 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0131  hypothetical protein  47.62 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225906  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  52.46 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3369  hypothetical protein  47.62 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0982  hypothetical protein  49.18 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0764635  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  49.21 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2248  hypothetical protein  46.03 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1035  putative transcriptor regulator  46.88 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112928  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1608  hypothetical protein  43.08 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  45 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0108043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  47.37 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  40.91 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  51.02 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  39.66 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  41.51 
 
 
69 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  46.55 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1960  hypothetical protein  37.29 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  38.81 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  41.54 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 
77 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3852  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0914  hypothetical protein  37.25 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  34.52 
 
 
170 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>