34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0393 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  63.91 
 
 		 504 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  84.06 
 
 		 502 aa  865    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  83.67 
 
 		 502 aa  863    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 502 aa  1019    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  89.84 
 
 		 502 aa  908    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  66.94 
 
 		 516 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  39.5 
 
 		 506 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  38.28 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  39.26 
 
 		 537 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  37.22 
 
 		 605 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  39.64 
 
 		 515 aa  348  9e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  37.27 
 
 		 595 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  37.72 
 
 		 526 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  37.07 
 
 		 600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  37.4 
 
 		 609 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  34.54 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  32.91 
 
 		 496 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  31.56 
 
 		 746 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.76 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  19.94 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  29.65 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 449 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.92 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  28.49 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.16 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 635 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 		 508 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 424 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>